痛风发病以脾肾两虚为本，湿热毒瘀为标，证属正虚邪实。如果先天禀赋不足，后天嗜食膏粱厚味，日久伤脾，或年老脾肾功能失调，则外感或内生湿热毒邪流窜经络，攻注骨节，着于经脉，终致湿热毒瘀交互为患。

《格致余论·痛风》云：“痛风者，大率因血受热已自沸腾，其后或涉冷水，或立于湿地……寒凉外搏，热血得寒，汗浊凝涩，所以作痛，夜则痛甚，行于阳也。”《景岳全书·脚气》中认为，本病外由阴寒水湿，湿邪袭皮肉筋脉，内由平素肥甘过度，湿壅下焦；寒与湿邪相结郁而化热，停留肌肤；病变部位红肿潮热，久则骨蚀。

西医学认为，痛风最重要的生化基础是高尿酸血症，原发性痛风与尿酸生成增多和尿酸排泄减少密切相关。尿酸生成增多主要与遗传因素、嘌呤代谢酶的缺陷有关。肾脏尿酸排泄减少与目前已发现的尿酸盐转运蛋白有关，任何一个转运蛋白基因表达或功能障碍都会引起尿酸排泄减少。痛风是常染色体多基因的显性遗传，可能存在易感基因或致病基因。继发性痛风则多由于肾脏疾病致尿酸排泄减少、骨髓增生性疾病致尿酸生成增多、某些药物抑制尿酸的排泄等多种原因引起的高尿酸血症所致。